Az Egyetemi Program az MCC képzéseinek zászlóshajója, amely a felsőoktatásban tanuló elsőéveseknek meghirdetett, egyéves Juniorképzésből, a másod- és harmadéveseknek szóló, kétéves iskolarendszeri képzésből áll. Az MCC jelenleg 7 városban (Budapesten, Debrecenben, Győrben, Miskolcon, Kolozsváron, Pécsen és Szegeden) kínál a hagyományos felsőoktatást kiegészítő, kiscsoportos, azon belül is személyre szabott, interdiszciplináris képzést, amely hiánypótló Magyarországon, de egész Európában is. A kurzusok döntően az egyetemi oktatás végeztével, este kezdődnek, így összeegyeztethetőek a felsőoktatási kötelezettségekkel, viszont az Egyetemi Program hallgatóinak ezért nem csak tehetségesnek, de szorgalmasnak és kitartónak is kell lenniük. Az Egyetemi Programon túl a mesterképzés idejére is kínálunk képzési lehetőséget az érdeklődők számára Posztgraduális Programjaink keretében.
Az Egyetemi Program első állomása a Juniorképzés, amelyre azok a középiskolai tanulmányaikat az adott évben befejező diákok jelentkezhetnek, akik a budapesti, debreceni, győri, kolozsvári, miskolci, pécsi és szegedi egyetemek nappali tagozatos hallgatóiként kívánják tanulmányaikat megkezdeni. A Juniorképzés célja, hogy magas színvonalú, közös nevezőre hozott alaptudást kínáljon a diákoknak, amelyet tanulmányaik és karrierútjuk során magabiztosan használhatnak.
Az Egyetemi Program Juniorképzést követő lépcsőfoka az iskolarendszerben való továbbtanulás. A kétéves képzésre az első egyetemi évüket sikeresen befejező hallgatók jelentkezhetnek, és hat iskola közül választhatnak. Az MCC iskolarendszeri képzésének célja, hogy diákjainknak egy-egy szakterületen elmélyült és biztos szakmai alapot nyújtó elméleti és gyakorlati ismereteket, egyéni fejlesztést és sajátos szemléletmódot adjunk. A diákok külön felvételi eljárás keretében az alábbi iskolákba nyerhetnek felvételt: Jogi Iskola, Közgazdaságtani Iskola, MCC-Mindset Pszichológia Iskola, Média Iskola, Nemzetközi Kapcsolatok Iskola, valamint Társadalom- és Történelemtudományi Iskola.
Az MCC Posztgraduális Programjai kínálatukkal a lehető legszélesebb körben, strukturált keretek között képezik le a diákok változatos igényeit. A Műhelytagság a kutatói, elemzői életpályát választók számára nyújt ugródeszkát. Ez a pálya folytatható tovább a Junior Kutatói Program keretében. A Vezetőképző Akadémia azok számára javasolt, akik gazdasági, közéleti vagy kulturális szervezetekben szeretnének irányító, vezető szerepet betölteni. A Janus Pannonius Programév hallgatói munka vagy tanulás mellett maradhatnak az MCC közösségének tagjai, közösségi fókuszú programokat szerveznek és ilyeneken vesznek részt, miközben továbbra is élhetnek az MCC nyújtotta lehetőségekkel. Az MCC Postgraduate Scholarship program keretében a diákok az MCC-vel együttműködésben álló külföldi egyetemeken tanulhatnak nemzetközi ösztöndíjas programok keretében. A fenti képzések közül legalább kettőt kell elvégezni a Posztgraduális Diploma megszerzéséhez.